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Estudio de ácidos nucleicos y sus sillares de construcción.

1.- Estructura del DNA.

1.1.- Emparejamiento de los nucleótidos.

1.1.1.- Pulsa este botón para ver el par T-A, con 2 enlaces de hidrógeno.
Puedes mostrar los enlaces por puente de H en color naranja.
El modelo espacial compacto que permite observar la proximidad entre las bases.
El par de bases es prácticamente plano y los anillos de pentosa perpendiculares a él.

1.1.2.- Par C-G, con 3 enlaces por hidrógeno de color naranja.


1.2.- Estructura secundaria del DNA: forma B o modelo de Watson y Crick.

1.2.1.- Dos dinucleótidos complementarios emparejan sus bases para formar un fragmento de B-DNA bicatenario (o de doble hebra): 5' pTpC 3' vs 3' ApGp 5'.
Podemos mostrar los enlaces de hidrógeno en color naranja.
Los pares de bases se sitúan paralelamente y en el interior, las pentosas y fosfatos (esqueleto) en el exterior.
Para poder emparejar todas las bases manteniendo los enlaces fosfodiéster, cada par de bases gira con respecto al anterior unos 36°.
En este modelo de Watson y Crick, o forma B del DNA, la vuelta de hélice corresponde aproximadamente a 10,5 pares de bases.

1.2.3.- La molécula (polinucleótido) forma una doble hélice dextrógira , en la que los puentes de H entre pares de bases complementarias se muestran en color naranja.

1.2.4.- Estudia el código de bases nitrogenadas del DNA.

1.2.5.- Estudia el esqueleto "fosfato+azúcar" del DNA.

1.3.- Otras estructuras del DNA: A-DNA, B-DNA y Z-DNA.

1.3.1.- A-DNA. Sentido de la hélice: dextrógira, diámetro: ~26 Å, pares de bases por vuelta: 11, desplazamiento de la hélice por para de bases: 2.6 Å, inclinación de la base respecto al eje de la hélice: 20º, conformación del azúcar: C3' endo, conformación del enlace glucosídico: anti.
1.3.2.- B-DNA. Sentido de la hélice: dextrógira, diámetro: ~20 Å, pares de bases por vuelta: 10.5, desplazamiento de la hélice por para de bases: 3.4 Å, inclinación de la base respecto al eje de la hélice: 6º, conformación del azúcar: C2' endo, conformación del enlace glucosídico: anti.
1.3.3.- Z-DNA. Sentido de la hélice: levógira, diámetro: ~18 Å, pares de bases por vuelta: 12, desplazamiento de la hélice por para de bases: 3.7 Å, inclinación de la base respecto al eje de la hélice: 7º, conformación del azúcar: C2' endo para las pirimidinas y C3´ endo para las purinas, conformación del enlace glucosídico: anti para las pirimidinas y syn para las purinas.



Créditos

Dr. Gregorio Fernandez Ballester. (IBMC-UMH)

Dr. Jesús M. Sanz Morales. (IBMC-UMH)

Dr. Ángel Herráez. (Universidad de Alcalá )
Material adaptado de http://biomodel.uah.es/model1j/. Se permite su utilización de acuerdo con la Licencia Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-CompartirIgual.

Dr. José Antonio Encinar. (IBMC-UMH)