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Research → Research tools → Scripts de OPUS 5.5/Bruker

1.- Convertir una serie de espectros con formato OPUS 5.5 (<name>.n) a formato SPC (*.dx): v1, v2.

2.- Convertir una serie de espectros con formato OPUS 5.5 (<name>.n) a formato PRN (*.prn): v1, v2.

3.- Restar automáticamente a una serie de espectros con formato OPUS 5.5 (<name>.n) un mismo espectro, generando espectros restados (4000-900 cm-1) con formato PRN (*.prn): v1.


4.- Restar automáticamente a una serie de espectros con formato OPUS 5.5 (<name>.n) un mismo espectro, generando espectros restados, cortados (1600-1522 cm-1, Amida II) y con línea de base, con formato PRN (*.prn): v1.


5.- Restar automáticamente a una serie de espectros (d:\bbb\<name>.nn) con formato OPUS 5.5 (<name>.nn) otra serie (<name2>.n) de espectros (también con formato OPUS), generando espectros (d:\bbb\spectra_prn\<name>.nnF.prn) restados, cortados (1700-1600 cm-1, Amida I) y con línea de base, con formato PRN (*.prn): v1.

IMPORTANTE: numerar las extensiones de los espectros name.00, name.01, name.02, name.03, name.04, name.05, name.06, name.07, name.08, name.09, name.10, etc.


6.- Con el script de Pyton 2.7: lectura_1618_1645.py se calcula la absorbancia de los espectros contados y con linea de base de la región amida I, a dos frecuencias: 1645 y 1618 cm-1. Relacionando la temperatura de adquisición de cada espectro con la razón de absorbancias 1618/1645 cm-1 se puede estimar la Tm de transición del estado plegado a desplegado de una proteína.


7.- Manual OPUS 5 Spectroscopy software: Base Package.

8.- Manual OPUS 6 Spectroscopy software: OEM dll.

9.- Manual OPUS 4 Spectroscopy software: programming.

10.- The Guide for Infrared Spectroscopy is a extensive collection of useful information and tables for IR spectroscopists.

11.- OPUS Error Reporting.

12.- Import and Export of Spectra Files. Claudia Beleites cbeleites@units.it. CENMAT and DI3, University of Trieste. The source code of this vignette including the spectra ?les are available as .zip ?le at hyperSpec's home page: http://hyperspec.r-forge.r-project.org/fileio.zip
Note that some de?nitions are in ?le vignettes.defs.

13.- Restar automáticamente a una serie de espectros (d:\bbb\<name>.nn) con formato OPUS 5.5 (<name>.nn) otra serie (<name2>.n) de espectros (también con formato OPUS), generando espectros (d:\bbb\spectra_tyr\Tyr-1525-1500-<name>.nn) restados, cortados (1525-1500 cm-1, Tyr band), con línea de base, y con peakpick, que llevan formato OPUS: v1.

IMPORTANTE: numerar las extensiones de los espectros name.00, name.01, name.02, name.03, name.04, name.05, name.06, name.07, name.08, name.09, name.10, etc.



14.- Macro de Rampa de temperatura: DELAY Rampa Temperatura v2. Incluye un "Retraso en el inicio de la rampa, segundos", pensado para dejar durante ese tiempo que la cámara de muestra se purgue de vapor de H2O y CO2. También se puede programar la temperatura a la que se retorna después de la rampa, por defecto 20ºC. Se incluye el número de ciclos y los ºC que se incrementa cada ciclo.



15.- Hoja de cálculo (Excel) para crear una Recta de calibrado de temperatura: recta_calibrado_baño.xls. Relaciona la temperatura programada en el baño termostatizador y la temperatura que alcanza la muestra, medida esta última con un termómetro.


16.- Filtros GRAMMS de interconversión de ficheros de datos: ejecución de windows 3.11 en el emulador DOXBOX.