Biomoléculas ON-LINE

Guia para usar JSmol --> Identificar partes

1.- Introducción 2.- Instalación y requisitos 3.- Ratón y teclado 4.- Menú 5.- Botones 6.- Tipos de modelos moleculares 7.- Cambio de modelo molecular 8.- Color 9.- Selección de grupos 10.- Identificar partes 11.- Puentes de H y S-S 12.- Otras opciones 13.- Volver a Biomoléculas ON-LINE

Si seleccionas los 4 residuos de Tyr de esta proteína y a continucación presentas su estilo como VdW al 50%, tendrás mayor facilidad para identificar la Tyr 10.

Si dejas quieto el puntero del ratón sobre un átomo de esta Tyr 10, al cabo de unos segundos aparece junto este su texto identificador: un grupo de letras y números como el que muestra esta imagen.

¿Cómo se interpreta este identificador [TYR]10:A.CB #79?

[TYR] El átomo elegido pertenece a un residuo de tirosina (Tyr).

Este residuo ocupa la posición 10 en la secuencia de la cadena polipeptídica desde el extremo N-Terminal.

El átomo está en la cadena A de la proteína.

CB El átomo es un carbono beta.
El átomo tiene el número 79 en el archivo de coordenadas.

Créditos

Dra. Mª Belén Garrido Garrido, Dr. Angel Herráez

Dr. José Antonio Encinar. (IBMC-UMH)