Guia para usar JSmol --> No necesitas instalar Java para usar JSmol

1.- Introducción 2.- Instalación y requisitos 3.- Ratón y teclado 4.- Menú 5.- Botones 6.- Tipos de modelos moleculares 7.- Cambio de modelo molecular 8.- Color 9.- Selección de grupos 10.- Identificar partes 11.- Puentes de H y S-S 12.- Otras opciones 13.- Volver a Biomoléculas ON-LINE

La aplicación JSmol no necesita instalarlación. Coloca el puntero del ratón encima de la estructura molecular que está girando, pulsa el botón izquierdo y mueve el ratón.

¡¡ESTAS MOVIENDO LA MOLÉCULA!!!

Si pulsas el botón derecho del ratón aparece un menú que te oferta muchas posibilidades...

En páginas sucesivas encontrarás:
--> botones (En este ejemplo se selecciona la Phe153, se presenta en spacefill y color naranja)
--> cajas seleccionables []
--> estructura secundaria.
--> volver al estado original:
Todos ellos te permitirán interactuar con JSmol y obtener diversa información de las estructuras moleculares que estés visializando en cada caso.

A partir de ahora, siguiendo las indicaciones de las distintas secciones del menú, aprenderás a hacer múltiples manipulaciones sobre los modelos moleculares que se ven en esta web.

Presenta la estructura de 1crn.pdb y comprueba los efectos de distintas formas de presentar dicha estructura:
a) spacefill b) wire c) ball&stick d) cartoons e) fancy not f) flat

Modifica el color: a) color atomno b) color cpk c) color structure

Identifica cada aminoácido: on, off. Escribe una etiqueta dentro de la ventana JSmol, larger, smaller.

Créditos

Dra. Mª Belén Garrido Garrido, Dr. Angel Herráez

Dr. José Antonio Encinar. (IBMC-UMH)