La miniaplicación JSmol no es necesario instalarla, pues se descarga sin que lo notes junto con las páginas web que la usan. Si quieres tener instalado en tu navegador Java puedes conseguirlo accediendo a la página web de Sun (la descarga es gratuita y muy sencilla, casi automática).
Coloca el puntero del ratón encima de la estructura molecular que está girando, pulsa el botón izquierdo y mueve el ratón.
¡¡ESTAS MOVIENDO LA MOLÉCULA!!!
Si pulsas el botón derecho del ratón aparece un menú que te oferta muchas posibilidades...
En páginas sucesivas encontrarás:
--> botones (En este ejemplo se selecciona la Phe153, se presenta en spacefill y color naranja)
--> cajas seleccionables []
--> enlaces.
--> Volver al estado original:
Todos ellos te permitirán interactuar con JSmol y obtener diversa información de las estructuras moleculares que estés visializando en cada caso.
A partir de ahora, siguiendo las indicaciones de las distintas secciones del menú, aprenderás a hacer múltiples manipulaciones sobre los modelos moleculares que se ven en esta web.
Presenta la estructura de 1crn.pdb y comprueba los efectos de distintas formas de presentar dicha estructura:
a) spacefill
b) wire
c) ball&stick
d) cartoons
e) fancy
not
f) flat
Modifica el color: a) color atomno
b) color cpk
c) color structure
Identifica cada aminoácido: on,
off.
Escribe una etiqueta dentro de la ventana JSmol,
larger,
smaller.
Dra. Mª Belén Garrido Garrido, Dr. Angel Herráez
Dr. José Antonio Encinar. (IBMC-UMH)